Application clinique de données génomiques chez Pseudomonas aeruginosa

P. aeruginosa peut causer des infections opportunistes très sévères, notamment chez les patients atteints de fibrose kystique (FK). En fait, la majorité de ces patients finit par développer une infection pulmonaire chronique, qui est la principale cause de morbidité et de mortalité associée à la maladie. La génomique appliquée à ces infections via le séquençage de génomes bactériens entiers offre le potentiel de transformer la pratique de la microbiologie clinique. Étant donné la diminution rapide des coûts et des temps de manipulation, le séquençage et l’analyse de génomes microbiens est en train de devenir une stratégie viable pour mieux comprendre les infections FK ainsi que d’autres types d’infections humaines et animales. L’objectif du « International P. aeruginosa Consortium », mené par le laboratoire Levesque, est de générer au moins 1000 génomes de P. aeruginosa, lier les données avec www.pseudomonas.com, intégrer l’information avec le registre canadien FK et développer des outils faciles à utiliser pour étudier ces génomes. Les données génomiques vont ainsi supporter l’épidémiologie moléculaire dans la détection des épidémies et dans le développement de tests de dépistage génétique de résistance aux antibiotiques, de marqueurs pronostiques et de cibles thérapeutiques. Ce projet est supporté par un consortium international et vise des retombées à grande échelle au profit de la microbiologie clinique et surtout, des patients FK.